擬似

2023 年 3 月 27 日

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サイエンスチャイナプレス著

最近、中国科学院深海科学工学研究所の何俊平博士が率いる研究チームは、研究成果をサイエンス中国生命科学誌のオンライン版に発表した。

彼らは、深海ウナギ (Ilyophis brunneus) の高品質なゲノムを初めて報告し、深海適応の分子機構に光を当てました。 深海ウナギのサンプルは、中国の有人潜水船「沈海永石」によってマリアナ海溝の深さ３５００メートルで採取された。 研究者らは、形態学的観察とミトコンドリアのバーコード解析により、このウナギが泥クズウナギ（MAE）であることを特定した。

ウナギの深海適応の分子機構を調査するために、研究者らはまず、イルミナのハイスループットシークエンシング、PacBio、および Hi-C テクノロジーを使用して MAE の高品質ゲノムを配列決定し、組み立てました。 その後、系統発生解析と比較ゲノム解析を実施して、その起源と適応メカニズムを解明しました。

この研究により、TUGBCP3遺伝子やITGA遺伝子など、細胞骨格の維持と調節に関連するいくつかの重要な遺伝子が特定の変異を受けており、これらの遺伝子が強力なポジティブセレクションを受けていることが明らかになった。 TUBGCP3 はγ-チューブリン複合体の必須成分であり、中心体における微小管の核形成に重要な役割を果たします。一方、ITGA は微小管の細胞骨格の安定性を促進し、細胞骨格の集合を調節します。

研究者らはまた、DNA修復能力、膜流動性、正常な転写および翻訳プロセス、エネルギー代謝に関連する、多数の遺伝子ファミリーが拡大、正の選択、急速な進化を遂げたことも発見した。

また、深海ウナギやヨーロッパウナギなどの浅海魚種の選択圧解析により、深海ウナギのω値が他の魚種に比べて有意に高いことが明らかになり、深海ウナギはおそらく極度の深海の環境で機能の加速進化を経験したと考えられます。 これらの遺伝的変異により、深海ウナギは極限の深海環境に適応する能力を進化させた可能性がある。

詳しくは： Jie Chen et al、深海ウナギ Ilyophis brunneus の擬似染色体長ゲノムアセンブリは深海への適応に光を当てる、Science China Life Sciences (2023)。 DOI: 10.1007/s11427-022-2251-8

雑誌情報:サイエンス 中国 ライフサイエンス

サイエンスチャイナプレス提供